Eukaryotické RNA podstupují celou řadu modifikací bazí. Některé z nich jsou důležité pro strukturu, mezimolekulární interakce či aktivitu RNA.
Nejčastější modifikací eukaryotické mRNA je teprve nedávno odhalená metylace adenosinového N6 rezidua (m6A). Přes její častý výskyt,
není úloha m6A zatím přesně známa. Bylo ukázáno, že dekorace RNA přes m6A je dynamický proces, což naznačuje jeho důležitost pro
regulační pochody.
Savčí buňky mají dvě demetylázy, FTO a AlkBH5, které dokáží odstranit m6A. FTO je medicínsky významný protein, pro jeho vazbu na vývoj
obezity u lidí. Přes intenzivní pozornost věnovanou FTO, není doposud známo, jaké RNA procesuje a jaká je přesně jeho funkce na
molekulární úrovni. Naším cílem je ocharakterizovat fyziologické substráty RNA pro FTO a pomocí proteomických studií zjistit úlohu m6A
modifikace v regulaci genové exprese. Naše výsledky významně rozšíří znalosti o úloze m6A v metabolismu RNA a roli FTO v buněčné
regulaci.

Publications