Project information
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Information

This project doesn't include Institute of Computer Science. It includes Faculty of Medicine. Official project website can be found on muni.cz.

Project Identification

NR8967

Project Period

1/2006 - 12/2009

Investor / Pogramme / Project type

Ministry of Health of the CR

Ministry of Agriculture R&D Programme

MU Faculty or unit

Faculty of Medicine

Cooperating Organization

St. Anne's University Hospital Brno

Responsible person doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
Responsible person Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
Responsible person prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
Responsible person MUDr. Jana Račovská

Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.

Publications

Total number of publications: 90

2012

Molekulární detekce syfilis, kmenová typizace a stanovení makrolidové rezistence u původce syfilis - Treponema pallidum ssp. pallidum v klinickém materiálu.

MIKALOVÁ Lenka POSPÍŠILOVÁ Petra FLASAROVÁ Magdalena ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2012, type: Conference abstract

2010

Celogenomové restrikční mapování u vybraných zástupců rodu Treponema.

MIKALOVÁ Lenka STROUHAL Michal ČEJKOVÁ Darina ZOBANÍKOVÁ Marie POSPÍŠILOVÁ Petra NORRIS S. J. SODERGREN E. WEINSTOCK G. M.

Conference abstract

Year: 2010, type: Conference abstract
Celogenomové restrikční mapování u 8 zástupců rodu Treponema.

MIKALOVÁ Lenka ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2010, type: Conference abstract
Clarithromycin treatment failure due to macrolide resistance in Treponema pallidum in a patient with primary syphilis.

WOZNICOVÁ Vladana ŠMAJS David POSPÍŠILOVÁ Petra ZÁKOUCKÁ Hana DASTYCHOVÁ Eliška FLASAROVÁ Magdalena VALIŠOVÁ Zuzana

Article in Periodical

Acta Dermato-Venereologica, year: 2010, volume: 90, edition: 2
Complete genome sequence of T. paraluiscuniculi, strain Cuniculi A: an evidence for adaptation of T. paraluiscuniculi to rabbits.

ŠMAJS David STROUHAL Michal ZOBANÍKOVÁ Marie ČEJKOVÁ Darina DUGAN-ROCHA S. POSPÍŠILOVÁ Petra NORRIS S.J. ALBERT T. QUIN X. HALLSWORTH-PEIN K. WEINSTOCK G.M.

Conference abstract

Year: 2010, type: Conference abstract
Genome analysis of Treponema pallidum subsp. pallidum and subsp. pertenue strains by whole genome fingerprinting: most of the genetic differences are localized in six genomic regions.

MIKALOVÁ Lenka STROUHAL Michal ČEJKOVÁ Darina ZOBANÍKOVÁ Marie POSPÍŠILOVÁ Petra NORRIS S.J. SODERGREN E. WEINSTOCK G.M. ŠMAJS David

Article in Periodical

PloS ONE, year: 2010, volume: 5, edition: 12
Identifikace genetických rozdílů mezi původci yaws a syfilis.

MIKALOVÁ Lenka STROUHAL Michal ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2010, type: Conference abstract
Molecular characterization of clinical isolates of Treponema pallidum subsp. pallidum in the Czech Republic.

POSPÍŠILOVÁ Petra FLASAROVÁ Magdalena ZÁKOUCKÁ H. WOZNICOVÁ Vladana WEINSTOCK G.M. ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2010, type: Conference abstract
Molekulární detekce syfilis: PCR diagnostika, typizace a detekce makrolidové rezistence u Treponema pallidum.

POSPÍŠILOVÁ Petra ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2010, type: Conference abstract
Najvirulentnejší zástupca rodu Treponema - Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 a jeho celogenómová sekvencia.

MIKOLKA Pavol POSPÍŠILOVÁ Petra ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2010, type: Conference abstract