Molekulové modelování se díky stále kvalitnějším modelům chemické reality i růstu výkonu počítačů stává účinným nástrojem i při studiu molekul středních a velkých. Jedním ze zásadních důvodů je fakt, že počítačové metody mohou v mnoha případech poskytnout údaje srovnatelné s experimentálními za výrazně nižší cenu a podstatně kratším čase. Důležitou součástí molekulového modelování, zejména u molekul biologického významu, je studium konformačního chování. V laboratoři navrhovatele a spolunavrhovatelů byly vyvinuty originální metodické postupy umožňuící provádět počítačové studium konformačního chování. Cílem předkládaného projektu je nadále rozvíjet tuto metodologii, zejména ve směru k paralelním a distribuovaným počítačům a výpočtům, aplikovat ji na molekuly fundamentálního významu v živých soustavách (peptidy, DNA) a studovat souvislost nízkoenergetických konformací a konformační flexibility základních stavebních kamenů (aminokyselin a nukleotidů).

Publications