Funkčný dopad variantu c.-140C>G v géne ANKRD26 a jeho úloha v rozvoji dedičnej trombocytopénie typu 2
| Title in English | Functional impact of the c.-140C>G variant in the ANKRD26 gene and its role in the development of hereditary thrombocytopenia type 2 |
|---|---|
| Authors | |
| Year of publication | 2024 |
| Type | Conference abstract |
| MU Faculty or unit | |
| Citation | |
| Attached files | |
| Description | Dedičné trombocytopénie (IT) predstavujú heterogénnu skupinu ochorení, charakterizovanú zníženým počtom trombocytov. Niektoré typy IT sú spojené so zvýšeným rizikom rozvoja hematologických malignít, vrátane dedičnej trombocytopénie typu 2 (THC2). THC2 je zapríčinená patogénnymi zárodočnými variantmi v kritickom regióne 5? neprekladanej oblasti génu ANKDR26, vedúcimi k trvalej nadmernej expresii ANKRD26, výsledkom čoho je defekt v tvorbe trombocytov a následná trombocytopénia. Variant c.-140C>G, prítomný podľa dbSNP u 6,2% nefínskej európskej populácie, má rozpornú klinickú interpretáciu. Informácie z databázy ClinVar naznačujú pravdepodobne benígny/benígny charakter, publikované prípady však spájajú variant s THC2. Naša štúdia sa zaoberá analýzou funkčného dopadu variantu c.-140C>G v kombinácii s hodnotením klinických testov. Na základe výsledkov celogenómového sekvenovania boli vybratí jednotlivci s variantom c.-140C>G a reprezentatívna vzorka kontrolných jedincov bez variantu. U všetkých jedincov bola stanovená expresia génu ANKRD26 pomocou polymerázovej reťazovej reakcie v reálnom čase. Výsledky našej analýzy ukazujú, že expresia ANKRD26 v trombocytoch sa signifikantne nelíši medzi skupinou jedincov s c.-140C>G variantom a kontrolnou skupinou. Agregačné testy nepreukázali významné konzistentné zmeny funkcie trombocytov v závislosti na prítomnosti c.-140C>G variantu. Navyše, všetci jednotlivci s c.-140C>G variantom mali normálny počet trombocytov. Výsledky tejto štúdie poskytujú prvý funkčný dôkaz benígneho charakteru variantu c.-140C>G v 5? neprekladanej oblasti génu ANKDR26 v súvislosti s THC2. Potvrdenie benígneho charakteru má význam pre prognózu jednotlivcov diagnostikovaných s c.-140C>G variantom, najmä pokiaľ ide o vylúčenie zvýšeného rizika rozvoja hematologických malignít. |
| Related projects: |