CERIT SC

Články

• A methodology for comparing optimization algorithms for auto-tuning

  FLORIS-JAN Willemsen SCHOONHOVEN Richard FILIPOVIČ Jiří TORRING Jacob O. NIEUWPOORT Rob van WERKHOVEN Ben van

  Článek v odborném periodiku

  Future Generation Computer Systems, rok: 2024, ročník: 109, vydání: October 2024, DOI

• Acceleration of Molecular Simulations by Parametric Time-Lagged tSNE Metadynamics

  HRADISKÁ Helena KUREČKA Martin BERÁNEK Jan TEDESCHI Guglielmo VIŠŇOVSKÝ Vladimír KŘENEK Aleš SPIWOK Vojtěch

  Článek v odborném periodiku

  The Journal of Physical Chemistry B, rok: 2024, DOI

• AlphaFind: discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB

  PROCHÁZKA David SLANINÁKOVÁ Terézia OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína JÁNOŠOVÁ Miriama ČILLÍK Jakub PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic acids research, rok: 2024, ročník: 52, vydání: July 5, DOI

• Analysis of metadynamics simulations by metadynminer.py

  BERANEK Jan KŘENEK Aleš SPIWOK Vojtěch

  Článek v odborném periodiku

  Bioinformatics, rok: 2024, ročník: 40, vydání: 10, DOI

• CzeGPT-2 – Training New Model for Czech Generative Text Processing Evaluated with the Summarization Task

  HÁJEK Adam HORÁK Aleš

  Článek v odborném periodiku

  IEEE ACCESS, rok: 2024, ročník: 2024, vydání: 12, DOI

• Factors influencing the efficacy of recombinant tissue plasminogen activator: Implications for ischemic stroke treatment

  VÍTEČEK Jan VÍTEČKOVÁ WÜNSCHOVÁ Andrea THALEROVÁ Sandra GULATI Sumeet KUBALA Lukáš CAPANDOVÁ Michaela HAMPL Aleš MIKULÍK Robert

  Článek v odborném periodiku

  Plos one, rok: 2024, ročník: 19, vydání: 6, DOI

• Forensic experts' view of forensic-ready software systems: A qualitative study

  DAUBNER Lukáš BÜHNOVÁ Barbora PITNER Tomáš

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Software: Evolution and Process, rok: 2024, ročník: 36, vydání: 5, DOI

• Getting your DUCs in a row - standardising the representation of Digital Use Conditions

  JEANSON Francis GIBSON Spencer J ALPER Pinar BERNIER Alexander WOOLLEY J Patrick MIETCHEN Daniel STRUG Andrzej BECKER Regina KAMERLING Pim GONZALEZ Maria del Carmen Sanchez MAH Nancy NOVAKOWSKI Ann WILKINSON Mark D BENHAMED Oussama Mohammed LANDI Annalisa KROG Georg Philip MÜLLER Heimo RIAZ Umar VEAL Colin HOLUB Petr VAN ENCKEVORT Esther BROOKES Anthony J

  Článek v odborném periodiku

  SCIENTIFIC DATA, rok: 2024, ročník: 11, vydání: 1, DOI

• High spatial and spectral resolution dataset of hyperspectral look-up tables for 3.5 million traits and structural combinations of Central European temperate broadleaf forests

  HANOUSEK Tomáš SLANINÁKOVÁ Terézia REBOK Tomáš JANOUTOVÁ Růžena

  Článek v odborném periodiku

  DATA IN BRIEF, rok: 2024, ročník: 57, vydání: December 2024, DOI

• ChannelsDB 2.0: a comprehensive database of protein tunnels and pores in AlphaFold era

  ŠPAČKOVÁ Anna VÁVRA Ondřej RAČEK Tomáš BAZGIER Václav SEHNAL David DAMBORSKÝ Jiří SVOBODOVÁ Radka BEDNÁŘ David BERKA Karel

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2024, ročník: 52, vydání: D1, DOI