Srovnávací analýza repetitivních sekvencí Trifolium pratense a Trifolium medium sekvenováním nové generace
Autoři | |
---|---|
Rok publikování | 2014 |
Druh | Konferenční abstrakty |
Fakulta / Pracoviště MU | |
Citace | |
Popis | Rod Trifolium (jetel) je jedním z agronomicky důležitých rodů čeledi Fabaceae. V České republice patří mezi nejvýznamnější zástupce jetel luční (T. pratense L.), který je kvalitní pícninou poskytující vysoké výnosy. Pro překonání nízké vytrvalosti byla v nedávné době provedena úspěšná mezidruhová hybridizace tetraploidního jetele lučního odrůdy Tatra (2n = 4x = 28) s planým oktoploidním jetelem prostředním (T. medium L.; 2n = 8x = 64). U obou druhů bylo provedeno sekvenování metodou Illumina a bioinformatická analýza získaných sekvencí s cílem charakterizovat repetitivní elementy. Druhová specifita byla potvrzena celkem u 2 elementů jetele lučního a 20 elementů jetele prostředního. Uvedené repetitivní elementy byly také lokalizovány na chromozomy příslušného druhu pomocí fluorescenční in situ hybridizace (FISH). |
Související projekty: |