Vývoj genově specifických DNA markerů pro skríning rostlin ve šlechtění jetele lučního

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	ŘEPKOVÁ Jana DLUHOŠOVÁ Jana NEDĚLNÍK Jan JAKEŠOVÁ Hana
Rok publikování	2016
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Úroda
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova	Trifolium pratense; SSR; genetic diversity
Popis	Jetel luční (Trifolium pratense) je celosvětově důležitá pícnina. Cílem práce byla identifikace SSR (simple sequence repeat) markerů v kódujících sekvencích pro celý genom. Charakterizovali jsme 4005 potenciálních markerů s produkty amplifikace 100 až 350 bp. Hustota markerů byla jeden SSR na 12,39 kbp. Celkem 95 SSR v kódujících sekvencích bylo validováno pro 50 českých i zahraničních odrůd jetele lučního a byla získána kolekce 22 vysoce polymorfních markerů s PIC (polymorphism information content) > 0.9. Tyto makery jsou vhodné pro studium diverzity u T. pratense a pro celogenomové studie vyhledávání markerů ve specifických genech využitelných ve šlechtění jetele lučního. Informace o příbuzenských vztazích u šlechtitelského materiálu jsou využitelné pro plánování křížení, ale i ochranu práv šlechtitelů prostřednictvím identifikace odrůd.
Související projekty:	Nové genomické postupy pro šlechtění cizosprašných plodin na zlepšení užitkových vlastností