Biochemical Space: A Language for Formal Description and Annotation of Complex Biological Processes

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	TROJÁK Matej DĚD Tadeáš ŠAFRÁNEK David KLEMENT Matej ČERVENÝ Jan ROMANOVSKÁ Františka
Rok publikování	2016
Druh	Další prezentace na konferencích
Fakulta / Pracoviště MU	Fakulta informatiky
Citace
Popis	Biochemical Space (BCS) is a novel framework for practical description of complex biological processes. It is developed as a part of Comprehensive Modelling Platform (CMP) - a web-based platform for modelling and analysis of biological processes. In the context of CMP, Biochemical Space glues together complicated quantitative models with an easy-to-understand but yet formal and compact qualitative description. BCS allows to specify formal and well-annotated reaction networks of chemical entities and elemental reactions onto which the mathematical models are projected. BCS is supported by a Biochemical Space Language (BCSL) that combines state-of-the-art rule-based techniques with meta-data formats developed in well-known annotation databases.
Související projekty:	Získávání parametrů biologických modelů pomocí techniky ověřování modelů