Synthetic long reads reconstruction using molecular barcoding

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Rekonstrukce syntetických dlouhých sekvencí za použití molekulárního barkodování
Autoři	DAVYDOV Alexey Nikolayevich
Rok publikování	2022
Druh	Projekty výzkumu a vývoje
Fakulta / Pracoviště MU	Středoevropský technologický institut
Citace
Popis	The project aims to implement our newly developed method for the unique molecular identifiers (UMIs) introduction into oligonucleotides. This method can be used for RNA/DNA next generation sequencing (NGS) libraries preparation. The structure of the generated sequencing libraries with the introduced UMIs allows for a downstream long-reads reconstruction and PCR error correction resulting in accurately quantified ‚phased‘ genomic sequences or full-length transcripts. The potential range of the technology applications is very broad, and includes various fields, such as medical genomics, pharmacogenomics, molecular diagnostics, cancer genomics, and others. In this project, we focused on applying the method for the analysis 16S RNA sequencing (metagenomics) and immunogenomics analysis (TCR and BCR repertoires).
Související projekty:	Posílení systému komercializace výsledků VaV na Masarykově univerzitě