Detekce a lokalizace genetických determinant faktorů virulence u Staphylococcus aureus pomocí molekulárních sond

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

MICHALOVÁ Eva RŮŽIČKOVÁ Vladislava HRADECKÁ Helena

Rok publikování 2003
Druh Článek ve sborníku
Konference VII Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Obor Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova Staphylococcus; virulence factors; molecular probes; PCR
Popis Alimentární enterotoxikózy, toxické epidermolýzy anebo syndrom toxického šoku jsou onemocnění způsobená toxickými exolátkami, produkovanými patogenními kmeny S. aureus. V této práci byly Southernovou hybridizací s digoxigeninem značenými molekulárními sondami, připravenými v PCR, lokalizovány sekvence genů kódujících enterotoxiny B, C1 a C2,3, exfoliatin A a termostabilní nukleázu (TN) na restrikčních spektrech HindIII a EcoRI nebo na makrorestrikčním spektru SmaI. Gen seb byl u všech SEB-pozitivních kmenů lokalizován v EcoRI spektru ve dvou kopiích na fragmentech 1,5-kb a 3,6-kb nebo 8,6-kb; v HindIII spektru pak většinou na fragmentu 6,1-kb, zatímco ve SmaI spektru se tento gen vyskytoval na různých fragmentech. Gen sec1 byl lokalizován nejčastěji na EcoRI fragmentu 8,5-kb a na HindIII fragmentu 5,0-kb. Ve SmaI spektru byl sec1 potvrzen na fragmentech ~44-kb, ~23-kb nebo ~74-kb. Gen eta byl u ETA-pozitivních kmenů většinou lokalizován na těchto fragmentech: SmaI ~200-kb, EcoRI 4,9 a 2,5-kb a na HindIII 6,2 a 4,2-kb. Gen sec2,3 byl zjištěn na větším počtu EcoRI a HindIII fragmentů a ve SmaI spektru pak nejčastěji na fragmentech ~44-kb a ~100-kb. Výskyt většího počtu signálů indikuje více kopií sekvencí genů kódujících enterotoxiny B a C. Hybridizací nebyla prokázána přítomnost genů seb, sec1 a sec2,3 na plazmidové DNA. Gen nuc, kódující termonukleázu, byl lokalizován na SmaI fragmentech ~280-kb až ~370-kb. Hybridizace kolonií umožnila detekovat přítomnost genu sec1 přímo v genomu bakterií vyrostlých v koloniích na živném agarovém médiu. Bylo prokázáno, že hybridizace genomové DNA se specifickou molekulární sondou vhodně doplňuje a upřesňuje molekulární diagnostiku virulentních kmenů S. aureus.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info