Molecular dynamics simulations of RNA kissing loop motifs reveal structural dynamics and formation of cation-binding pockets

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	RÉBLOVÁ Kamila ŠPAČKOVÁ Naděžda ŠPONER Judit KOČA Jaroslav ŠPONER Jiři
Rok publikování	2003
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Nucleic Acids Research
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biofyzika
Klíčová slova	RNA; kissing loop motifs; molecular dynamics; cation-binding pockets
Popis	Loop-loop interactions between RNA hairpins represent an important class of RNA-RNA recognition motifs. These `kissing-loop' complexes participate in antisense regulation of a variety of cellular processes in prokaryotic cells and in bacteriophages. To under-stand the function of kissing complexes, we have carried out molecular dynamics simulations on two types of RNA kissing structures.
Související projekty:	Biomolekulární centrum