Příprava vzorku pro analýzu proteomu leukemických buněk BM2 dvourozměrnou elektroforézou

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	VÁŇA Petr ŠMARDA Jan
Rok publikování	2004
Druh	Článek ve sborníku
Konference	1. česká proteomická konference
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Onkologie a hematologie
Klíčová slova	Two-dimensional electrophoresis; proteome analysis; sample preparation
Popis	Výsledek dvourozměrné elektroforézy (2D) proteinů výnamně závisí na způsobu přípravy vzorku. Cílem této práce bylo stanovit optimální podmínky pro přípravu vzorku kuřecích monoblastů transormovaných onkogenem v-myb. Modifikací lyzačního (9 M urea, 2 % NP-40, 3 % CHAPS, 70 mM DTT, 2 % ampholyte pH 8-10.5) a rehydratačního pufru (8 M urea, 4 % CHAPS, 100 mM DTT, 0.001 % bromphenol blue, 0.2 % ampholyte pH 3-10)přidáním thiomočoviny jsme zřetelně zvýšili počet proteinů rozlišitelných v 2D gelu. Sonikací vzorku jsme dále zvýšili počet a densitu proteinů na elektroforetogramu. Přítomnost thiomočoviny v lyzačním/rehydratačním pufru a sonikace zvýšila počet rozlišitelných proteinových skvrn přibližně osmkrát. Tyto experimentální podmínky použijeme při analýze proteomu během diferenciace monoblastů BM2.
Související projekty:	Studium molekulárních mechanismů způsobujících supresi v-Myb s využitím přístupů proteomiky