Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny
Autoři | |
---|---|
Rok publikování | 2004 |
Druh | Článek ve sborníku |
Konference | Sborník abstraktů XIII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2004 |
Fakulta / Pracoviště MU | |
Citace | |
Obor | Genetika a molekulární biologie |
Klíčová slova | colicin; immuinity proteins |
Popis | Bylo zkonstruováno 16 hybridních proteinů kolicinů U/Y. Byly nalezeny 3 aminokyselinové zbytky hrající klíčovou roli v interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem a 4 aminokyselinové zbytky důležité pro tutéž interakci u kolicinu Y. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem jsou klíčové aminokyselinové zbytky F576, G580 a L594. Další interakční místo se nachází v pozici 590-592 (L590, A591, V592). Oproti tomu pro interakci kolicinu Y s jeho imunitním proteinem jsou významné jiné aminokyselinové zbytky, a to Y586, V590, A594 a A595. Menší význam v této interakci má i některá z 34 aminokyselin C-konce kolicinu Y (z nichž 12 je rozdílných oproti kolicinu U). Aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y interagující s příslušnými imunitními proteiny jsou lokalizovány do hydrofobní sekvence mezi helixy 8 a 9 kolicinové domény vytvářející kanál v plazmatické membráně. |
Související projekty: |