Paenibacillus sepulcri sp. nov., isolated from biodeteriorated mural paintings in the Servilia tomb

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Paenibacillus sepulcri sp. nov., izolovaný z nástěných maleb poškozených živými organismy v hrobce v Servilii
Autoři	ŠMERDA Jakub SEDLÁČEK Ivo PÁČOVÁ Zdenka KREJČÍ Eva HAVEL Ladislav
Rok publikování	2006
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
www	Abstrakt
Obor	Mikrobiologie, virologie
Klíčová slova	Paenibacillus; DNA DNA hybridization; 16S rDNA; chemotaxonomy; phenotypic analysis
Popis	V roce 2001 byla izolována z nástěných maleb poškozených živými organismy v hrobce v Servilii gram-variabilní, fakultativně anaerobní bakterie, tvořící endospory. Tato bakterie byla uložena ve sbírce LMG pod názvem Paenibacillus sp. s katalogizačním číslem LMG 19508. Kmen byl následně charakterizován pomocí fenotypových a molekulárních metod. Sekvenace a následné porovnání sekvence 16S rRNA genu potvrdili, že kmen náleží do rodu Paenibacillus a odalili jeho blízký vztah k druhu Paenibacillus mendelii CCM 4839T (96,7% sekvenční podobnosti). Převládající menachinon byl typ MK-7. Buněčné stěny obsahovaly meso-diaminopimelovou kyselinu typu A1. Obsah G+C (50%mol) a převládající mastná kyselina kmene LMG 19508T byla v souladu s charakteristikami rodu Paenibacillus. Nicméně, DNA-DNA hybridizace odlišili kmen LMG 19508T od ostatních fylogeneticky příbuzných druhů. Usuzujeme, že izolát představuje nový druh - Paenibacillus sepulcri sp. nov. Typový kmen je kmen CCM 7311T (=LMG 19508T).
Související projekty:	Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase Centrum pro výzkum biodiverzity