Restrikční mapování blízce příbuzných spirochet rodu Treponema.

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Lékařskou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	STROUHAL Michal ŠMAJS David
Rok publikování	2006
Druh	Konferenční abstrakty
Fakulta / Pracoviště MU	Lékařská fakulta
Citace
Popis	Cíl: Stanovit rozdíly mezi genomy čtyř blízce příbuzných spirochet rodu Treponema metodou DNA fingerprintingu. Materiál a metody: Byly vyšetřeny kmeny Nichols, SS14 (T. p. pallidum), Samoan D (T. p. pertenue) a Cuniculi A (T. paraluiscuniculi). Na základě kompletní nukleotidové sekvence kmene Nichols byly genomy vybraných zástupců rozděleny do 97 překrývajících se intervalů; intervaly byly amplifikovány a štěpeny restrikčními enzymy BamH I, EcoR I a Hind III. Restrikční profily jednotlivých kmenů byly srovnány a použity k identifikaci heterologních oblastí. Rozdíly v genomech byly soustředěny zejména do skupiny tpr genů a do skupiny hypotetických genů, které se nacházejí v jejich blízkosti. Ukazuje to na možnost, že rozdílná virulence treponemálních kmenů je podmíněna relativně malými odlišnostmi v příslušných genomech. Identifikovaných nukleotidových záměn lze využít při molekulární identifikaci treponemálních kmenů a izolátů.
Související projekty:	Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů