Možnosti komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) a array-CGH při detekci prognostických markerů u neuroblastomu
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2006 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | II. dny diagnostické, prediktivní a experimentální onkologie |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Klíčová slova | Neuroblastoma; chromosomal aberrations; high resolution comparative genomic hybridization; array-CGH; GenoSenzor |
| Popis | Neuroblastom je pevný dětský tumor periferního nervového systému. Patří mezi nejčastější dětské solidní tumory, představuje přibližně 7 až 10 % všech pediatrických nádorových onemocnění a je příčinou asi 15 % úmrtí na nádorová onemocnění v dětství. Neuroblastom je charakteristický svou výraznou genetickou rozmanitostí, která způsobuje jeho různorodé klinické chování. Tyto genetické změny jsou typické pro jednotlivá stádia onemocnění a jejich stanovení je využíváno k odhalování biologických vlastností nádoru a pro racionální volbu individuální terapie. Ke stratifikaci jednotlivých pacientů do rizikových podskupin (vysoké-HR, střední-IMR, nízké-LR) jsou v klinické praxi doposud užívána následující kriteria: klinické stadium (INSS), věk v době diagnózy, N-myc amplifikace, histologie (tzv. Shimadova klasifikace) a DNA index. V současnosti však do běžné klinické praxe začínají pronikat i další molekulárně biologické a cytogenetické markery ovlivňující stratifikaci pacientů s neuroblastomem. Mezi prognostické znaky, které jsou součástí nové léčebné strategie COG (Childrens Oncology Group) patří nově i průkaz del 1p a LOH 11q, přidatné informace o biologických vlastnostech nádoru však mohou poskytnout i změny na chromozomech 3p či 17q. Mezi další příznivé biologické vlastnosti nádoru patří i hyperdiploidní karyotyp, minimum strukturálních změn chromozomů, zatímco diploidní karyotyp či četné strukturální změny chromozomů charakterizují nádory s nepříznivými biologickými vlastnostmi. K identifikaci doposud známých prognosticky významných cytogenetických znaků u neuroblastomu jsou dnes vedle klasické cytogenetiky a interfázní fluorescenční hybridizace (I-FISH) používány zejména metody celogenomového screeningu založené na technikách komparativní genomové hybridizace (CGH) či komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH). Rezoluční limit těchto technik dosahuje 3 až 5 Mb. V poslední době se stále více prosazují techniky genetické profilace jednotlivých subtypů neuroblastomu pomocí technologie array-CGH, Tento přístup umožňuje určování změn počtu kopií mnoha genů zapojených do procesu tumorigeneze a představuje metodu k s velkým potenciálem pro stanovování genetických markerů neuroblastomu. V letech 1998-2006 bylo v Laboratoři molekulární cytogenetiky OLG FN Brno ve spolupráci s Klinikou dětské onkologie FN Brno provedeno molekulárně cytogenetické vyšetření primární nádorové tkáně celkem u 50 dětí s neuroblastomem. K identifikaci prognosticky významných cytogenetických znaků byly používány nejprve techniky interfázní fluorescenční hybridizace (I-FISH), od roku 2001 jsou též používány metody komparativní genomová hybridizace (CGH) a komparativní genomová hybridizace s vysokým rozlišením (HR-CGH). V roce 2006 jsme provedli první vyšetření pacientů s neuroblastomem pomocí technologie array-CGH (GenoSenzor Array 300). Naše práce shrnuje cytogenetické nálezy u pacientů ve vztahu ke klinickým údajům a dokumentuje přinos jednotlivých metod k detekci prognosticky významných cytogenetických znaků u neuroblastomu. |
| Související projekty: |