Computation of tunnels in protein molecules using Delaunay triangulation
| Název česky | Výpočet tunelů v proteinech pomocí Delaunayovy triangulace |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2007 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | Journal of WSCG |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| www | http://wscg.zcu.cz/WSCG2007/Papers_2007/journal/F53-full.pdf |
| Obor | Informatika |
| Klíčová slova | tunnels; protein molecule; Delaunay triangulation |
| Popis | Článek představuje novou metodu analýzy kavit v molekulách proteinů. Biochemický výzkum ukázal, že chování molekuly proteinu závisí na existenci kavit (tunelů), které vedou ze vnitřku molekuly na povrch. Předchozí metody výpočtu tunelů byly založeny na rasterizaci prostoru. Náš přístup je založen na výpočetní geometrii a používá Voroného diagram a Delaunayovu triangulaci. Naše metoda určí tunely v lepší kvalitě v přijatelném výpočetním čase. Navržený algoritmus byl implementován a testován na několika reálných proteinech. Nalezne uplatnění v různých aplikacích moldeování proteinů a jejich analýzy. |
| Související projekty: |