Shape-specific recognition in the structure of the Vts1p SAM domain with RNA

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

OBERSTRASS Florian LEE Albert ŠTEFL Richard JANIS Michael CHANFREAU Guillaume ALLAIN Frederic

Rok publikování 2006
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Obor Biochemie
Klíčová slova SACCHAROMYCES-CEREVISIAE; REPRESSES TRANSLATION; DEADENYLASE COMPLEX; DROSOPHILA EMBRYO; DIPOLAR COUPLINGS; CRYSTAL-STRUCTURE; CCR4-NOT COMPLEX; GENE-EXPRESSION
Popis Although the abundant sterile alpha motif (SAM) domain was originally classified as a protein-protein interaction domain, it has recently been shown that certain SAM domains have the ability to bind RNA, defining a new type of post-transcriptional gene regulator. To further understand the function of SAM-RNA recognition, we determined the solution structures of the SAM domain of the Saccharomyces cerevisiae Vts1p (Vts1p-SAM) and the Smaug response element (SRE) stem-loop RNA as a complex and in isolation. The structures show that Vts1p-SAM recognizes predominantly the shape of the SRE rather than its sequence, with the exception of a G located at the tip of the pentaloop. Using microarray gene profiling, we identified several genes in S. cerevisiae that seem to be regulated by Vts1p and contain one or more copies of the SRE.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info