Určení kompletní genomové sekvence kmene Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2

• Autoři: ČEJKOVÁ Darina; STROUHAL Michal; MATĚJKOVÁ Petra; ŠMAJS David
• Rok publikování: 2007
• Druh: Konferenční abstrakty
• Fakulta / Pracoviště MU: Lékařská fakulta
• Popis: Treponema pallidum ssp. pallidum je původcem pohlavně přenosné syfilis. T. pallidum ssp. pertenue vyvolává endemickou treponematózu zvanou yaws vyskytující se v tropickém a subtropickém pásmu. Původci obou onemocnění byli objeveni před více než 100 lety (Schaudinn et al. 1905, Castellani 1905). Zástupce T. pallium nelze kultivovat kontinuálně v in vitro podmínkách. Oba podruhy jsou blízce příbuzné organizmy.Jednotlivé druhy, popř. poddruhy treponemy nelze rozeznat morfologicky ani serologicky (Antal et al. 2002, Norris et al. 2001). Určení kompletní sekvence genomu T. pallidum ssp. pallidum Nichols (AE000520, Fraser et al. 1998) otevřelo nové možnosti výzkumu. K určení kompletní genomové sekvence T. pallidum ssp. pertenue kmene CDC-2 byla použita sekvenační metoda vyvinutá firmou 454 Life Sciences (454 sekvenování) v kombinaci se standardní enzymatickou metodou dle Sangera. Cílem této práce je stanovení rozdílů mezi genomy syfilitického kmene Nichols a kmene CDC-2 způsobujícího yaws.

Související projekty

• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
• Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum