Biomarker discovery in low grade breast cancer using isobaric stable isotope tags and two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry (iTRAQ-2DLC-MS/MS) based quantitative proteomic analysis
| Název česky | Detekce potenciálních biomarkerů karcinomu prsu nízkého stupně malignity pomocí proteomové analýzy na principu isobarického značení stabilními izotopy, dvourozměrné chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie (iTRAQ-2DLC-MS/MS) |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2008 |
| Druh | Konferenční abstrakty |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Prezentovaná studie představuje první využití metody proteomové analýzy na principu kombinace značení stabilními izotopy, dvourozměrné chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie (iTRAQ-2DLC-MS/MS) pro srovnání proteinového složení dvou primárních nádorů prsu nízkého stupně malignity (metastazující a nemetastazující) a metastáze v lymfatické uzlině. Hlavními cíli studie bylo: (1) definovat proteinové spektrum detegovatelné touto metodou a (2) odhalit protenciální kandidátní biomarkery pro následné ověřovací a validační studie. Pomocí studie bylo detegováno 605 proteinů (p<0.05), z nichž 3/3 proteiny měly zvýšenou/sníženou hladinu v metastazujícím primárním nádoru a 13/6 proteinů mělo zvýšenou/sníženou hladinou v metastázi v lymfatické uzlině ve srovnání s nemetastazujícím primárním nádorem. Změny v hladinách vybraných proteinů byly úspěšně validovány pomocí kvantitativní PCR v reálném čase. |
| Související projekty: |