C-13 Relaxation Study of RNA Dynamics: Application to UUCG Hairpin Loop
| Název česky | Studium dynamiky RNA pomocí relaxace C-13: Aplikace na smyčku UUCG |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2008 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | 23rd NMR Valtice |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Biochemie |
| Klíčová slova | dynamics; NMR spectroscopy; nucleic acid; relaxation; chemical shift anisotropy |
| Popis | Metoda model-free, která se používá ke studiu dynamiky molekul na základě NMR relaxace byla rozšířena o explicitní zahrnutí vlivu asymetrického charakteru tenzoru chemického stínění uhlíku C-13. Výsledky poskytované vylepšenou metodou byly studovány na tetradekameru RNA obsahující smyčku UUCG. Relaxační parametry byly měřeny pro všechny protonované atomy uhlíku v bázích a uhlíku C1’ při 600 MHz a 500 MHz. Výsledky dosažené s pomocí rozšířené metody model-free jsou porovnávány s výsledky získanými standardním postupem a rovněž s publikovanými daty. |
| Související projekty: |