Detekce nebalancovaných chromozómových aberací u mnohočetného myelomu pomocí komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) a techniky Array-CGH

• Autoři: ZAORALOVÁ Romana; VRANOVÁ Vladimíra; KUGLÍK Petr; GREŠLIKOVÁ Henrieta; FILKOVÁ Hana; NĚMEC Pavel; SMETANA Jan; KUPSKÁ Renata; SLÁMOVÁ Iva; POUR Luděk; KŘIVANOVÁ Andrea; KREJČÍ Marta; ADAM Zdeněk; HÁJEK Roman
• Rok publikování: 2008
• Druh: Konferenční abstrakty
• Fakulta / Pracoviště MU: Lékařská fakulta
• Popis: Molekulárně cytogenetické analýzy pomocí techniky komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) patří k metodám komplexního genomového screeningu nádorových buněk. Tato metoda nevyžaduje metafázní chromozomy, a proto je vhodná zejména k vyšetřování genetických abnormalit u hematologických malignit s nízkou mitotickou aktivitou nádorových buněk. Technika HR-CGH umožňuje odhalit nebalancované přestavby chromozomů vedoucí ke ztrátě nebo zmnožení genetického materiálu o velikosti nad 3 Mb a je proto často využívaná k diagnostice a prognostické klasifikaci jednotlivých maligních onemocnění či jejich subtypů. S využitím analýzy genomu pomocí čipových technologií se výrazně zvýšila citlivost určování genetických změn u nádorů. Metoda array-CGH pomocí oligonukleotidových DNA mikročipů umožňuje detegovat dávku genů a změny počtu kopií až desítek tisíců genů souvisejících s patogenezí onemocnění v rámci jediného vyšetření. Moderní DNA čipové analýzy s vysokým rozlišením umožňují citlivou identifikaci nových genetických markerů důležitých pro diagnostiku, klasifikaci a predikci vývoje mnoha nádorových onemocnění. V této práci uvádíme příklad využití techniky HR-CGH a array-CGH u 25 pacientů s diagnózou mnohočetného myelomu (MM). Pro techniku array-CGH jsme použili komerční oligonukleotidový DNA čip Agilent 4x44K. Cílem experimentů bylo doplnit výsledky cytogenetických analýz prováděných pomocí techniky FISH u nemocných s MM o další nebalancované abnormality chromozomů a porovnat účinnost obou metod při vyšetření DNA z buněk kostní dřeně a CD 138+ separovaných plazmocytů. Výsledky experimentů prokázaly, že techniky HR-CGH i array-CGH zachytí všechny nebalancované změny v nádorovém genomu detegované metodou FISH (delece 13q14 a 17p13, zisk 1q). Pomocí array-CGH byly navíc nalezeny další změny v počtu kopií jednotlivých genů, jejichž studium může přinést nové poznatky využitelné v diagnostice a léčbě MM.

Související projekty

• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Univerzitní výzkumné centrum - Česká myelomová skupina (URC - CMG)