Biomarker discovery in low-grade breast cancer using isobaric stable isotope tags and two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry (iTRAQ-2DLC-MS/MS) based quantitative proteomic analysis

• Název česky: Vyhledávání biomarkerů karcinomu prsu nízkého stupně malignity pomocí proteomové analýzy s použitím značek se stabilními izotopy a dvourozměrné chromatografie s tandemovou hmotnostní spektrometrií (iTRAQ-2DLC-MS/MS)
• Autoři: BOUCHAL Pavel; ROUMELIOTIS Theodoros; HRSTKA Roman; NENUTIL Rudolf; VOJTĚŠEK Bořivoj; GARBIS Spiros D.
• Rok publikování: 2009
• Druh: Článek v odborném periodiku
• Časopis / Zdroj: Journal of Proteome Research
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Doi: http://dx.doi.org/10.1021/pr800622b
• Obor: Biochemie
• Klíčová slova: Breast cancer; biomarkers; proteomics; mass spectrometry; liquid chromatography; iTRAQ
• Popis: Prezentovaná studie představuje první využití metody proteomové analýzy na principu kombinace značení stabilními izotopy, dvourozměrné chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie (iTRAQ-2DLC-MS/MS) pro srovnání proteinového složení dvou primárních nádorů prsu nízkého stupně malignity (metastazující a nemetastazující) a metastáze v lymfatické uzlině. Hlavními cíli studie bylo: (1) definovat proteinové spektrum detegovatelné touto metodou a (2) odhalit protenciální kandidátní biomarkery pro následné ověřovací a validační studie. Pomocí studie bylo detegováno 605 proteinů.

Související projekty

• Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
• Studium molekulárních mechanismů adaptace bakterií na změny prostředí pomocí proteomických technik
• Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu