Large-Scale Free Energy Calculations as Showcase of Worldwide Grid Usability

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	STŘELCOVÁ Zora KULHÁNEK Petr KMUNÍČEK Jan KOČA Jaroslav MATYSKA Luděk
Rok publikování	2009
Druh	Konferenční abstrakty
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Popis	In biochemical or chemical disciplines, the free energy forms a basis for the assessment of theoretical models towards experimental data. Unfortunately, its calculation is still very time consuming task. Recently, we have implemented and tested the multiple walker approach, which significantly accelerates such kind of calculations, in a cluster environment. Since this approach requires only small communication overhead, we would like to extend and test it in a grid environment too.
Související projekty:	Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím Biomolekulární centrum