FastGrid -- The Accelerated Computation of Potential Maps for Molecular Docking

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	FastGrid -- akcelerovaný výpočet potenciálových map pro molekulový docking
Autoři	OLŠÁK Marek FILIPOVIČ Jiří PROKOP Martin
Rok publikování	2009
Druh	Software
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
www	http://code.google.com/p/fastgrid/
Popis	FastGrid je fork AutoGridu, který slouží k výpočtu map interakčních energií v okolí makromolekuly pro různé typy atomů. Tyto mapy jsou následně použity programem AutoDock pro výpočet celkové energie komplexu ligand-makromolekula. FastGrid je náhrada AutoGridu, která vykazuje obdobné chování jako AutoGrid 4.2.1 a je více než 100x rychlejší v závislosti na velikosti molekuly a map.
Související projekty:	Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy