In silico mutagenesis and docking study of RSL lectin

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Vyzkum In silico mutagenezy a dockovania RSL lectinu
Autoři	MISHRA Sushil Kumar ADAM Jan WIMMEROVÁ Michaela ABAGYAN Ruben A. KOČA Jaroslav
Rok publikování	2010
Druh	Konferenční abstrakty
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Popis	The gram-negative bacterium Ralstonia solanacearum produces a potent L-fucose binding lectin (RSL). This work is focused on in silico mutagenesis, docking of fucose and fucosylated oligosaccharides in RSL lectin. Binding energy pattern of various saccharides was investigated by a series of docking simulations. Docking experiments were performed using the software AutoDock 3, AutoDock Vina, DOCK v.6.2 and ICM Dock. Performance of various docking programs will be discussed with respect to binding energy of those saccharides measured from SPR experiment.
Související projekty:	Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím Biomolekulární centrum Návrh antibakteriálních a antivirových léků na bázi cukrů a glykomimetik