Gelová elektroforéza osmiem značených oligonukleotidů s následnou detekcí kovu pomocí LA-ICP-MS

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	DOSOUDILOVÁ Klára NEJEZCHLEBOVÁ Hana KOSTEČKA Pavel TRNKOVÁ Libuše BITTOVÁ Miroslava
Rok publikování	2010
Druh	Článek ve sborníku
Konference	Sborník 14. česko – slovenské spektroskopické konference
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biochemie
Klíčová slova	oligonucleotides; OsO4; gel electrophoresis
Popis	Nukleové kyseliny (NK), respektive nukleotidy obsažené v jejich struktuře, mohou interagovat s vybranými sloučeninami a komplexy kovů, čehož lze využít při studiu jejich struktury a vlastností. Příkladem je značení pyrimidinových bází směsí oxidu osmičelého (OsO4) a dusíkatého ligandu (L), kdy dochází ke vzniku ternárních komplexů. Díky selektivitě takového značení k jednotlivým bázím lze sledovat například bodové mutace nebo jiná poškození DNA. Nejvyšší tendence k tvorbě komplexu s OsO4 a 2,2 bypiridinem (Os,bipy) byla pozorována v pořadí thymin; methylcytosin; uracil; cytosin. Při tomto značení však velmi záleží na pozici pyrimidinu v rámci oligonukleotidového řetězce. Krajní pozice se modifikují ochotněji než pozice uvnitř řetězce, navíc pozice dvou pyrimidinů vedle sebe jejich značení zpomaluje
Související projekty:	Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu