New path planning method for computation of constrained dynamic channels in proteins

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	BENEŠ Petr STRNAD Ondřej SOCHOR Jiří
Rok publikování	2011
Druh	Článek ve sborníku
Konference	WSCG Full papers proceedings
Fakulta / Pracoviště MU	Fakulta informatiky
Citace
www	http://wscg.zcu.cz/WSCG2011/!_2011_WSCG_Full_papers.pdf
Obor	Informatika
Klíčová slova	protein; path planning; collision-free path; constrained dynamic channel
Popis	Bezkolizní cesty v geometrickém modelu molekuly proteinu odkrývají různé závislosti mezi strukturou a funkcí molekuly. Cesty spojující biochemicky důležité části uvnitř proteinu s povrchem mohou sloužit jako vstupní nebo výstupní cesty pro malé molekuly (substráty), které mohou v těchto důležitých částech zreagovat a tím i změnit funkci celého proteinu. Geometrický plánovací algoritmus prezentován v tomto článku byl navržen pro hledání cest v prostředí hustě pokrytém sférickými pohybujícími se překážkami. Ukázková implementace řeší výpočet bezkolizních cest v molekulárním prostředí. Na algoritmus jsou kladeny další omezující podmínky např. časová souslednost průchodu robota. Algoritmus byl testován na reálných datech a z výsledků můžeme konstatovat, že pokud byla cesta v datech přítomna, náš algoritmus ji úspěšně detekoval.
Související projekty:	CPG - Centrum počítačové grafiky Posílení zapojení studentů Fakulty informatiky do mezinárodní vědecké komunity