Optimization of mass spectral features in MALDI-TOF MS profiling of Acinetobacter species

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Optimalizace parametrů MALDI-TOF hmotnostních spekter Acinetobacter sp.
Autoři	ŠEDO Ondrej VORÁČ Aleš ZDRÁHAL Zbyněk
Rok publikování	2011
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Systematic and Applied Microbiology
Fakulta / Pracoviště MU	Středoevropský technologický institut
Citace
Doi	http://dx.doi.org/10.1016/j.syapm.2010.11.008
Obor	Analytická chemie, separace
Klíčová slova	Acinetobacter sp.; bacteria identification; MALDI-TOF MS
Popis	Vliv složení roztoku matrice, formy vzorku a metody nanášení vzorku na kvalitu MALDI-TOF hmotnostních spekter byl zkoumán s ohledem na zlepšení a automatizovatelnost metody. Bylo zjištěno, že použití kyselin ferulové nebo sinapové jako matricí může zlepšit rozlišení a poměr signál/šum, kyselina alfa-kyano-4-hydroxyskořicová oproti tomu byla jedinou matricí, která poskytla hmotnostní spektra automatickým sběrem dat. Robustnost celého postupu byla testována na 25 kmenech Acinetobacter sp. Pozorována byla možnost reprodukovatelně detekovat jemné rozdíly mezi spektry, nicméně nebyla potvrzena možnost spolehlivé klasifikace na kmenové úrovni.
Související projekty:	Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů Vývoj diagnostiky a léčby závažných onemocnění srdce a cév pomocí genomických a epigenomických přístupů Metody tlumení produkčních chorob skotu - BVD-MD a paratuberkulóza