Development of a Crystallization Protocol for the DbeA1 Variant of Novel Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium elkani USDA94

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Vývoj krystalizace protokolu pro DbeA1 Variant nových dehalogenázy Haloalkane z Bradyrhizobium elkani USDA94
Autoři	PRUDNIKOVA Tanyana CHALOUPKOVÁ Radka SATO Yukari NAGATA Yuji DEGTJARIK O. KUTÝ Michal REZACOVA P. DAMBORSKÝ Jiří KUTA-SMATANOVÁ Smatanova I.
Rok publikování	2011
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Crystal Growth & Design
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Doi	http://dx.doi.org/10.1021/cg1013363
Obor	Biochemie
Klíčová slova	Crystallization; X-ray;Haloalkane dehalogenases
Popis	The DbeA1 variant of a novel haloalkane dehalogenaseDbeA (EC 3.8.1.5) from Bradyrhizobium elkani USDA94 was constructed to study the structure-function relationships between DbjA and DbeA enzymes. A DbeA1 variant carries a unique fragment of nine amino acids transplanted from the sequentially closely related enzyme DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110 to DbeA. Here we report development of the crystallization protocol for DbeA1 and soaking experiments with the ligands 1-fluoropentane and 1,3-dichloropropane.
Související projekty:	Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální , regionální a lokální úrovni Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí