Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2011 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Chemické listy |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Biochemie |
| Klíčová slova | protein quantification; mass spectrometry; proteomics |
| Popis | Monitorování vybraných reakcí (selected reaction monitoring, SRM) je kvantitativní hmotnostně-spektrometrická technika, která se stále více uplatňuje v kvantitativní analýze proteinů na bázi stanovení peptidů. Instrumentace sestává z nanoprůtokové kapalinové chromatografie spojené s ionizací elektrosprejem a hmotnostním spektrometrem na bázi trojitého kavdrupólu. První kvadrupól funguje jako hmotnostní filtr propouštějící vybraný peptid, který je fragmenován ve druhém kvadrupólu pomocí kolizí indukované disociace. Třetí kvadrupól propouští vybrané peptidové fragmenty, které následně dopadají na detektor. Tetnto přístup umož%nuje cílenou kvantifikaci desítek proteinů v jediné analýze s vysokou citlivostí a selektivitou. SRM se proto stává klíčovou metodou tzv. cílené proteomiky. Nejdůležitější aplikace spočívají ve výzkumu živých systémů kde SRM umožňuje rychlé, přesné a cenově přijatelné stanovení proteinů ve velkých počtech vzorků. |
| Související projekty: |