Metodologie stanovení variability alel MHC genů u ryb čeledi Cyprinidae

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	CIVÁŇOVÁ Kristína VETEŠNÍKOVÁ ŠIMKOVÁ Andrea HEJLOVÁ Kristýna MARTIN Jean-Francois
Rok publikování	2011
Druh	Konferenční abstrakty
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Popis	K analýze variability exprimovaných genů DAB1 a DAB3 u kaprovitých ryb jsme použili 2 metody. První metoda zahrnuje SSCP analýzu, klonování PCR amplikonů, a automatické sekvenování. Jako druhou jsme optimalizovali přípravu vzorků pro „klonální“ sekvenování druhé generace (NGS – next generation sequencing) s využitím technologie 454 pyrosekvenování. V příspěvku srovnáváme klady a zápory námi používaných metod testování.
Související projekty:	Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase Úloha imunitní investice v kontextu kompromisů: imunoekologické studium vztahů mezi reprodukcí, imunitou a parazitizmem u sladkovodních ryb Hostitelsko-parazitické interakce v hybridních systémech kaprovitých ryb