Nucleosome DNA sequence structure of isochores

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	FRENKEL Zakharia M. BETTECKEN Thomas TRIFONOV Eduard
Rok publikování	2011
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	BMC Genomics
Fakulta / Pracoviště MU	Středoevropský technologický institut
Citace
Doi	http://dx.doi.org/10.1186/1471-2164-12-203
Obor	Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova	NUCLEOTIDE-SEQUENCE; CHROMATIN DNA; SPLICE SITES; PATTERN; ELEGANS; GENOME
Popis	Significant differences in G+C content between different isochore types suggest that the nucleosome positioning patterns in DNA of the isochores should be different as well. Nucleosome positioning pattern as revealed by Shannon N-gram extension is strongly dependent on G+C content and different in different isochores. Species-specificity of the pattern is subtle. It is reflected in the choice of preferentially periodical dinucleotides.
Související projekty:	Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací CHROMPLANT