Informace o projektu
Využití kombinace laserových mikrosvazkových a cytometrických technik ke studiu struktury a dynamiky lidského genomu
- Kód projektu
- IAA1065203
- Období řešení
- 1/2002 - 12/2006
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Akademie věd ČR
- Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména AV ČR
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- optical-tweezers; optical-scalpel; high-resolution-cytometer; confocal- microscopy; chromatin-struct
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba Ing. Emilie Lukášová, CSc.
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Pavel Zemánek, Ph.D.
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Miroslav Liška, DrSc.
Podstatou projektu je využít metod a experimentálních sestav optické pinzety, optického skalpelu a automatizovaného cytometru, které byly vyvinuty za finanční podpory předcházejících projektů, ke studiu mechanických vlastností a uspořádání interfázního chromatinu v jádrech živých i fixovaných lidských buněk. Teoretické a experimentální zkušenosti interdisciplinárního týmu řešitelů budou využity: - k fluorescenčnímu barvení chromatinu živých buněk, - k laserem indukované fúzi živých fluorescenčně označených buněk, - k topologické analýze rozložení obarvené oblasti chromatinu v jádrech živých a fixovaných buněk, - ke vnášení fluorescenčně obarvených nanosond do jádra živé buňky, optickému zachycení sondy a vymezení prostoru, který je pro sondu nedostupný, s mikrometrovým rozlišením, - ke studiu mechanických vlastností chromatinu s využitím optických manipulací s vhodnými sondami. Získané poznatky budou využity pro vývoj nových diagnostických metod.
Výsledky
Využít kombinace laserových mikrosvazkových a cytometrických technik ke studiu struktury a dynamiky lidského genomu.
Publikace
Počet publikací: 12
2007
-
Chromatin dynamics during DSB repair
Biochimica et Biophysica Acta, Molecular Cell Research, rok: 2007, ročník: 1773, vydání: 10
2006
-
Analýza lokalizace a interakce fluorescenčně značených molekul v živých i fixovaných lidských buňkách.
Rok: 2006, druh: Konferenční abstrakty
-
Directional motion of foreign plasmid DNA to nuclear HP1 foci
Chromosome Research, rok: 2006, ročník: 14, vydání: 5
-
Optical tracking of microobjects within living cells
Proceedings of SPIE, rok: 2006
2004
-
Colocalization of PML bodies and PML/RARalpha microspeckles with up- and down-regulated loci and changes of chromatin structure in APL leukemia cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Dynamics of HP1 transgene loci movement and silencing in living cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
In vivo imaging of cell interior using automated high-resolution cytometry
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Methylation of histone H3K9 in human blood cells and in granulocytes of patients with myeloid leukemia
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Topography of genetic loci in the nuclei of cells of colorectal carcinoma and adjacent tissue of colonic epithelium
Chromosoma, rok: 2004, ročník: 112, vydání: 5
2003
-
Detailed studies of the human genome 3D structure
Biophysics of the Genome, rok: 2003