Informace o projektu
Vývoj metodologie s vysokým rozlišením pro NMR studie neuspořádaných proteinů s vysoce degenerovanými rezonančními frekvencemi (HIGHRES)

Informace

Projekt nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.

Kód projektu

GAP206/11/0758

Období řešení

1/2011 - 12/2013

Investor / Programový rámec / typ projektu

Grantová agentura ČR

Standardní projekty

Fakulta / Pracoviště MU

Středoevropský technologický institut

prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.

Cílem projektu je vyvinout metody vysoce rozlišené NMR spektroskopie pro studium strukturních rysů a vnitřní dynamiky neuspořádaných proteinů s vysokou degenerací rezonančních frekvencích, například v důsledku repetitivnosti aminokyselinové sekvence.

Publikace

Počet publikací: 9

2014

Toward optimal-resolution NMR of intrinsically disordered proteins

NOVÁČEK Jiří ŽÍDEK Lukáš SKLENÁŘ Vladimír

Článek v odborném periodiku

Journal of Magnetic Resonance, rok: 2014, ročník: 241, vydání: April, DOI

2013

Efficient protocol for backbone and side-chain assignments of large, intrinsically disordered proteins: transient secondary structure analysis of 49.2 kDa microtubule associated protein 2c

NOVÁČEK Jiří JANDA Lubomír DOPITOVÁ Radka ŽÍDEK Lukáš SKLENÁŘ Vladimír

Článek v odborném periodiku

Journal of Biomolecular NMR, rok: 2013, ročník: 56, vydání: 4, DOI
Multiple Recognition Motifs in Nucleoporin Nup159 Provide a Stable and Rigid Nup159-Dyn2 Assembly

NYARKO Afua SONG Yujuan NOVÁČEK Jiří ŽÍDEK Lukáš BARBAR Elisar

Článek v odborném periodiku

Journal of Biological Chemistry, rok: 2013, ročník: 288, vydání: 4, DOI
NMR Determines Transient Structure and Dynamics in the Disordered C-Terminal Domain of WASp Interacting Protein

HABA Noam Y GROSS Renana NOVÁČEK Jiří SHAKED Hadassa ŽÍDEK Lukáš BARDA-SAAD Mira CHILL Jordan H

Článek v odborném periodiku

Biophysical Journal, rok: 2013, ročník: 105, vydání: 2, DOI

2012

4D Non-uniformly sampled HCBCACON and (1) J(NC alpha)-selective HCBCANCO experiments for the sequential assignment and chemical shift analysis of intrinsically disordered proteins

NOVÁČEK Jiří HABA Noam Y CHILL Jordan H ŽÍDEK Lukáš SKLENÁŘ Vladimír

Článek v odborném periodiku

Journal of Biomolecular NMR, rok: 2012, ročník: 53, vydání: 2, DOI

2011

5D 13C-detected experiments for backbone assignment of unstructured proteins with a very low signal dispersion

NOVÁČEK Jiří ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK Anna PAPOUŠKOVÁ Veronika ŽÍDEK Lukáš ŠANDEROVÁ Hana KRÁSNÝ Libor KOZMINSKI Wiktor SKLENÁŘ Vladimír

Článek v odborném periodiku

Journal of Biomolecular NMR, rok: 2011, ročník: 50, vydání: 1, DOI
Cloning and expression of endolysin and its SH3b-domain from polyvalent staphylococcal bacteriophage

BENEŠÍK Martin NOVÁČEK Jiří JANDA Lubomír DOPITOVÁ Radka ŽÍDEK Lukáš DOŠKAŘ Jiří PANTŮČEK Roman

Konferenční abstrakty

Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
Cloning, expression and structure determination of SH3b cell wall binding domain of bacteriophage 812 endolysin

BENEŠÍK Martin NOVÁČEK Jiří JANDA Lubomír DOPITOVÁ Radka ŽÍDEK Lukáš DOŠKAŘ Jiří RŮŽIČKOVÁ Vladislava MOŠA Marek PANTŮČEK Roman

Konferenční abstrakty

Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
Molekulární analýza plazmidů u exfoliatin B-produkujících kmenů Staphylococcus aureus izolovaných v letech 1998 – 2008 v České republice

KOSTÝLKOVÁ Karla RŮŽIČKOVÁ Vladislava MACHOVÁ Ivana DOSTÁLOVÁ Lucie

Konferenční abstrakty

Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty