Informace o projektu
Trojrozměrná analýza buněčných jader s využitím obrazové cytometrie
- Kód projektu
- GP204/03/D034
- Období řešení
- 9/2003 - 8/2006
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Postdoktorské projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- obrazová cytometrie s vysokým rozlišením, FISH, 3D analýza obrazu
Zařízení nazývané obrazový cytometr s vysokým rozlišením umožňuje provádět detailní studie (při rozlišení srovnatelném s konfokální mikroskopií) na velkém množství buněčných jader obarvených metodou FISH (1000-10000 objektů). Cytometr nachází uplatnění jak v základním biologickém výzkumu struktury genetického materiálu uvnitř buněčného jádra, tak v klinických aplikacích. Jedná se o špičkový a světově jedinečný přístroj, který byl vyvinut v naší laboratoři. Jeho omezením však je, že nedokáže plně pracovat ve trojrozměrném prostoru. Podstatou navrhovaného projektu je rozšířit možnosti obrazového cytometru s vysokým rozlišením tak, aby na něm bylo možné provádět kompletní trojrozměrnou analýzu velkého počtu buněčných jader. Možnosti cytometru jsou dány analyzačním subsystémem, který bude rozšířen tak, aby vyhodnocovací počítač dokázal ve své operační paměti vytvořit trojrozměrný počítačový model buněčného jádra. Díky tomuto modelu bude možné rozšířit sadu měření, kterou cytometr poskytuje.
Výsledky
Lze očekávat, že řešení projektu přispěje k rozvoji světově jedinečného a vysoce ceněného přístroje na studium struktury genetické informace v jádře buňky, a to s ohledem na možnost provádět kompletní studie ve 3D prostoru. Průběžné výsledky budou prezentovány na mezinárodních konferencích. Celkové výsledky potom v kvalitním mezinárodním časopise.
Publikace
Počet publikací: 7
2006
-
Fast and Robust Segmentation of Low Contrast Biomedical Images
Visualization Imaging and Image Processing, rok: 2006
-
Fast Point-Based 3D Alignment of Live Cells
IEEE Transactions on Image Processing, rok: 2006, ročník: 15, vydání: 8
-
Improved 3D Reconstruction of Interphase Chromosomes Based on Nonlinear Diffusion Filtering
Proceedings of PDE-Based Image Processing and Related Inverse Problems, rok: 2006
2004
-
Fast Marching 3D Reconstruction of Interphase Chromosomes
Computer Vision and Mathematical Methods in Medical and Biomedical Image Analysis, rok: 2004
-
High-Resolution Cytometry Network Project: Client/Server System for 3D Optical Microscope Data Storage and Analysis
2nd International Symposium on 3D Data Processing, Visualization, and Transmission, rok: 2004
-
Image analysis of the movement of sub-cellular structures
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Rapid Image Acquisition of Living Cells and its Limits
Biophysics of the Genome, rok: 2004