Informace o projektu
Multidisciplinární přístup k návrhu léčiv - Inhibice proteinů s návazností na sacharidy
(MADICA)
- Kód projektu
- LH13055
- Období řešení
- 3/2013 - 12/2015
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- KONTAKT II (od projektů s počátkem řešení v roce 2011)
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
- Mgr. Gita Paulíková, Ph.D.
Existuje několik možných přístupů k drug designu. Velmi častou cílovou látkou jsou enzymy, ale může to být také nukleová kyselina či dokonce ribosom. Mezi nové typy léčiv patří také ta, která jsou založena na napodobení molekul sacharidů. Cílem jsou dvě skupiny proteinů uplatňujících se v infekčních a nádorových onemocněních, a to mono a oligosacharidy rozpoznávající proteiny (lektiny z patogenů) a enzymy oligosacharidy syntetizující (patogenní a lidské glykosytransferasy). Smysl a síla česko-americké spolupráce spočívá v kombinaci komplementární expertízy české strany v oblasti glykobiochemie a výpočetní chemie a americké strany v obecné oblasti návrhu léčiv.
Publikace
Počet publikací: 24
2016
-
The GlcNAc-TV Glycosyltransferase Homology Model Strucutre
Rok: 2016, druh: Konferenční abstrakty
-
Three-dimensional homology model of GlcNAc-TV glycosyltransferase
Glycobiology, rok: 2016, ročník: 26, vydání: 7, DOI
2015
-
Exploring Reaction Pathways for O-GlcNAc Transferase Catalysis. A String Method Study
Journal of Physical Chemistry B, rok: 2015, ročník: 119, vydání: 12, DOI
-
How Does the Methodology of 3D Structure Preparation Influence the Quality of pK(a) Prediction?
Journal of Chemical Information and Modeling, rok: 2015, ročník: 55, vydání: 6, DOI
-
PatternQuery: web application for fast detection of biomacromolecular structural patterns in the entire Protein Data Bank
Nucleic Acids Research, rok: 2015, ročník: 43, vydání: W1, DOI
-
Structural insights into Aspergillus fumigatus lectin specificity: AFL binding sites are functionally non-equivalent
ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY, rok: 2015, ročník: 71, vydání: March, DOI
-
ValidatorDB: database of up-to-date validation results for ligands and non-standard residues from the Protein Data Bank
Nucleic Acids Research, rok: 2015, ročník: 43, vydání: D1, DOI
2014
-
Ab Initio QM/MM molecular dynamics simulations of glycosyltransferases
Rok: 2014, druh: Konferenční abstrakty
-
Catalytic Mechanism of the ppGalNAcT2 Retaining Glycosyltransferase Inferred From QM/MM Calculations
Rok: 2014, druh: Další prezentace na konferencích
-
Combined QM/MM MERP and PES calculations on retaining glycosyltransferase ppGalNAcT2
Rok: 2014, druh: Konferenční abstrakty