Informace o projektu
Strukturní biofyzika makromolekul

Informace

Projekt nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.

Kód projektu

GD204/03/H016

Období řešení

1/2003 - 12/2006

Investor / Programový rámec / typ projektu

Grantová agentura ČR

Doktorské granty

Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

prof. RNDr. Viktor Brabec, DrSc.
prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.

Klíčová slova

DNA, bílkoviny, struktura, rakovina, cytostatika

Cílem tohoto doktorského projektu je podpořit, koordinovat a zefektivnit vědeckou činnost v rámci doktorského studijního programu v oborech molekulární biofyzika a biologie. Realizací tohoto projektu dojde ke koordinovanému postupu v tomto doktorskémstud ijním programu dvou brněnských pracovišť s příbuzným a vzájemně se doplňujícím odborným zaměřením z oblasti molekulární biofyziky a biologie, jmenovitě přírodovědecké fakulty MU - Národního centra pro výzkum biomolekul a Biofyzikálního ústavu AV ČR.Širší metodologickou orientaci studentů podílejících se na řešení tohoto projektu umožní využití vzájemně se doplňujícího a špičkového metodického a přístrojového vybavení pro výzkum zaměřený na studium struktury biomakromolekul a jejich interakcímetodami mol ekulární biofyziky a biologie.

Publikace

Počet publikací: 40

2011

Comparison of protein structural motifs – challenges and algorithms. Improved approach and case studies

SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka SEHNAL David PRAVDA Lukáš OPPELT Jan IONESCU Crina-Maria GEIDL Stanislav KOČA Jaroslav

Konferenční abstrakty

Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
Docking study of matrix metalloproteinase inhibitors

RYŠKA Jan MISHRA Sushil Kumar SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav

Konferenční abstrakty

Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
Fast methods of atomic charge calculation: the Electronegativity Equalization Method for proteins.

IONESCU Crina-Maria SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka SEHNAL David SKŘEHOTA Ondřej KOČA Jaroslav

Konferenční abstrakty

Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
Predicting pKa values of substituted phenols from atomic charges.

GEIDL Stanislav SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka SKŘEHOTA Ondřej KUDERA Michal IONESCU Crina-Maria SEHNAL David BOUCHAL Tomáš KOČA Jaroslav

Konferenční abstrakty

Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
QSPR modeling – algorithms, challenges and IT solutions

SKŘEHOTA Ondřej SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka GEIDL Stanislav KUDERA Michal SEHNAL David IONESCU Crina-Maria BOUCHAL Tomáš KOČA Jaroslav

Konferenční abstrakty

Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty

2010

Why acetylcholinesterase reactivators do not work in butyrylcholinesterase

WIESNER Jiří KŘÍŽ Zdeněk KUČA Kamil JUN Daniel KOČA Jaroslav

Článek v odborném periodiku

Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry, rok: 2010, ročník: 25, vydání: 3

2009

Understanding the NMR Chemical Shifts for 6-halopurines: Role of Structure, Solvent, and Relativistic Effects

STANDARA Stanislav MALIŇÁKOVÁ Kateřina MAREK Radek MAREK Jaromír HOCEK Michal STRAKA Michal VAARA Juha

Článek ve sborníku

Modeling Interactions in Biomolecules IV, rok: 2009

2008

Mechanism of Hydrogen Bond Array Isomerization in Tetrahydroxycalix[4]arene and Tetrahydroxythiacalix[4]arene

MATOUŠEK Jiří ČAJAN Michal KULHÁNEK Petr KOČA Jaroslav

Článek v odborném periodiku

Journal of Physical Chemistry A, rok: 2008, ročník: 112, vydání: 1
P-31 Chemical Shift Tensors in Nucleic Acids from the Quantum Chemistry Point of View

PRECECHTELOVA Jana PADRTA Petr MUNZAROVA Marketa SKLENÁŘ Vladimír

Článek ve sborníku

23rd NMR Valtice, rok: 2008

2007

Acetylcholinesterases - the similarities and differences

WIESNER Jiří KŘÍŽ Zdeněk KUČA Kamil JUN Daniel KOČA Jaroslav

Článek v odborném periodiku

Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry, rok: 2007, ročník: 22, vydání: 4