Informace o projektu
Studium role polyhydroxyalkanoátů u bakterie Schlegelella thermodepolymerans – slibného bakteriálního kandidáta pro biotechnologie nové generace
(PHAST)
- Kód projektu
- GA22-10845S
- Období řešení
- 1/2022 - 12/2024
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Další fakulta/pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D.
- Mgr. Barbora Popelářová
- Spolupracující organizace
-
Vysoké učení technické v Brně
- Odpovědná osoba Doc. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D.
Schlegelella thermodepolymerans je termofilní bakterie, která byla isolována na základě své schopnosti biodegradace polymerních materiálů. Nicméně v nedávné době naše skupina identifikovala významný biotechnologický potenciál této bakterie v kontextu bioprocesů nové generace. Kromě degradace polymerních materiálů je S. thermodepolymerans schopna také produkce polyhydroxyalkanoátů (PHA), mikrobiálních polyesterů, které bakterie využívají jako zásobní zdroje energie a uhlíku. Schopnost produkce PHA však také navyšuje stresovou odolnost buněk vůči široké škále environmentálních stresorů. PHA zároveň představují ekologickou alternativu k petrochemickým polymerům. V rámci předloženého projektu bude podrobně prostudován metabolizmus PHA u S. thermodepolymerans a to v kontextu stresové robustnosti bakterie, bude sestaven podrobný metabolický model bakterie, budou vyvinuty a optimalizovány nástroje pro editaci genomu a v neposlední řadě bude bakterie otestována v kontextu nejslibnějších aplikací – produkce PHA, biodegradace polymerů a biotransformace/degradace fenolických látek.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 12
2024
-
BNClassifier: Classifying Boolean Models by Dynamic Properties
Computational Methods in Systems Biology, rok: 2024
2023
-
Boolean network sketches: a unifying framework for logical model inference
Bioinformatics, rok: 2023, ročník: 39, vydání: 4, DOI
-
Combining formal methods and Bayesian approach for inferring discrete-state stochastic models from steady-state data
Plos one, rok: 2023, ročník: 18, vydání: 11, DOI
-
Developing a genetic manipulation toolkit for Caldimonas thermodepolymerans
Rok: 2023, druh: Další prezentace na konferencích
-
Phenotype Control of Partially Specified Boolean Networks
Computational Methods in Systems Biology, rok: 2023
-
PUSH-based Strategy to Increase Glycolytic Flux in Pseudomonas putida from co-Utilized Cellulosic Sugars to Biopolymer Precursors
Rok: 2023, druh: Další prezentace na konferencích
-
Rule-based Modelling of Biological Systems Using Regulated Rewriting
Biosystems, rok: 2023, ročník: 225, vydání: 104843, DOI
-
Temporary and Permanent Control of Partially Specified Boolean Networks
BIOSYSTEMS, rok: 2023, ročník: 223, vydání: JAN, DOI
-
Water potential governs the effector specificity of the transcriptional regulator XylR of Pseudomonas putida
Environmental Microbiology, rok: 2023, ročník: 25, vydání: 5, DOI
2022
-
Building the SynBio community in the Czech Republic from the bottom up: You get what you give
Biotechnology Notes, rok: 2022, ročník: 3, vydání: December, DOI