Informace o projektu
Dispozice, výskyt a zpracování DNA lézí v genomu rostlin Arabidopsis thaliana defektních pro reparaci DNA a sestavování nukleozomů

Informace

Projekt nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.
Logo poskytovatele
Kód projektu
GA23-06643S
Období řešení
1/2023 - 12/2025
Investor / Programový rámec / typ projektu
Grantová agentura ČR
Fakulta / Pracoviště MU
Středoevropský technologický institut
Spolupracující organizace
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Rostliny A.thaliana postrádající histonový chaperon Chromatin assembly factor 1 (fas1 and fas2 mutanty) vykazují známky nestability genomu, např. hromadění DNA lézí, ztrátu repetic a tandemové duplikace genů. Naše nedávná studie ukázala, že k potlačení ztráty repetic u fas1 rostlin dochází při absenci ATM kinázy ve fas1atm mutantní linii. Protože ATM představuje klíčový regulační protein při opravách dvouřetězcových DNA zlomů (DSBs), vedoucí ke ztrátě repetic, zůstává otázkou, jak často je tento typ lézí formován ve fas1atm rostlinách a zda DSB představují primární typ poškození ve fas1. Není také zcela jasné, jakým způsoben jsou léze ve fas1 a fas1atm rozpoznány a opravovány. V tomto projektu využijeme přístupů DNA damage-seq k odhalení genomové distribuce DNA lézí a objasníme dopad jednotlivých reparačních drah při zpracování poškození DNA pomocí in vivo mikroskopie. Cílem v širším měřítku je prozkoumat klíčové otázky zabývající se odolností rostlinných systémů vůči vnějším a vnitřním genotoxickým zdrojům, a to za využití rostlin defektních v opravných mechanizmech DNA.

Cíle udržitelného rozvoje

Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.

Cíl udržitelného rozvoje č.  3 – Zdraví a kvalitní život Cíl udržitelného rozvoje č.  9 – Průmysl, inovace a infrastruktura Cíl udržitelného rozvoje č.  15 – Život na souši

Publikace

Počet publikací: 4


Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info