Project information
Role mesopolyploidie v evoluci celedi Brassicaceae

Information

This project doesn't include Institute of Computer Science. It includes Central European Institute of Technology. Official project website can be found on muni.cz.
Investor logo
Project Identification
GA13-10159S
Project Period
2/2013 - 12/2015
Investor / Pogramme / Project type
Czech Science Foundation
MU Faculty or unit
Central European Institute of Technology

Celogenomové duplikace (polyploidie) hrají u rostlin klícovou roli pri vzniku genetické diversity. Na rozdíl od paleopolyploidie, evolucne mladší mesopolyploidní duplikace jsou detekovatelné pomocí srovnávací cytogenetiky a genomiky. Naše predbežná
cytogenetická analýza bona fide diploidních druhu ukázala, že v cel. Brassicaceae se vyskytlo nekolik mesopolyploidních duplikací. Cílem projektu je identifikovat a charakterizovat mesopolyploidní duplikace v cel. Brassicaceae pomocí srovnávacího
malování chromosomu a sekvencní analýzy transkriptomu. Budou rekonstruovány ancestrální subgenomy mesopolyploidních taxonu, stejne jako proces genomové diploidizace. Dále budou zkoumány prestavby karyotypu duplikovaných genomu a mechanismy redukce poctu chromosomu u quasi-diploidních druhu. Sekvencní analýza celogenomového transkriptomu bude použita k potvrzení cytogenetických dat a k analýze fylogenetické pozice celogenomových duplikací. Bude testováno zda
mesopolyploidní duplikace mely prímý impakt na adaptivní radiaci a druhovou rozmanitost mesopolyploidních taxonu.

Publications

Total number of publications: 3


You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.

More info