Přejít k obsahu | Přejít k hlavnímu menu | Přejít k vyhledávání

Informace o projektu
Role mesopolyploidie v evoluci celedi Brassicaceae

Informace

Projekt nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.
Logo poskytovatele
Kód projektu
GA13-10159S
Období řešení
2/2013 - 12/2015
Investor / Programový rámec / typ projektu
Grantová agentura ČR
  • Standardní projekty
Fakulta / Pracoviště MU
Středoevropský technologický institut

Celogenomové duplikace (polyploidie) hrají u rostlin klícovou roli pri vzniku genetické diversity. Na rozdíl od paleopolyploidie, evolucne mladší mesopolyploidní duplikace jsou detekovatelné pomocí srovnávací cytogenetiky a genomiky. Naše predbežná
cytogenetická analýza bona fide diploidních druhu ukázala, že v cel. Brassicaceae se vyskytlo nekolik mesopolyploidních duplikací. Cílem projektu je identifikovat a charakterizovat mesopolyploidní duplikace v cel. Brassicaceae pomocí srovnávacího
malování chromosomu a sekvencní analýzy transkriptomu. Budou rekonstruovány ancestrální subgenomy mesopolyploidních taxonu, stejne jako proces genomové diploidizace. Dále budou zkoumány prestavby karyotypu duplikovaných genomu a mechanismy redukce poctu chromosomu u quasi-diploidních druhu. Sekvencní analýza celogenomového transkriptomu bude použita k potvrzení cytogenetických dat a k analýze fylogenetické pozice celogenomových duplikací. Bude testováno zda
mesopolyploidní duplikace mely prímý impakt na adaptivní radiaci a druhovou rozmanitost mesopolyploidních taxonu.

Publikace

Počet publikací: 3

2017

2016

2015

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info