RNA kink-turns as molecular elbows: Hydration, cation binding, and large-scale dynamics

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	RNA kink-turn jako molekulové lokty: Hydratace, vazba iontů a dynamika
Autoři	RÁZGA Filip ZACHARIAS Martin RÉBLOVÁ Kamila KOČA Jaroslav ŠPONER Jiří
Rok publikování	2006
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Structure
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Fyzikální chemie a teoretická chemie
Klíčová slova	Kink-turn; A-minor motif; RNA flexibility; Molecular Dynamics; Ribosome function
Popis	K-turn motivy jsou funkční klíčové RNA elementy (např:A-site finger and L7/L12 stalk), které regulují flexibilitu ribosomální RNA během procesu translokace. Explicit solvent MD simulace ukazují, že tyto struktury jsou asociovány se sití molekul vod, které významně ovlivňují jejich konformace.
Související projekty:	Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím Strukturní biofyzika makromolekul