Trapped water molecules are essential to structural dynamics and function of a ribozyme

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Zachycené molekuly vod jsou esenciální pro strukturní dynamiku a funkci ribozymů
Autoři	RHODES Maria REBLOVA Kamila NILS Walter SPONER Jiri
Rok publikování	2006
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	The Proceedings of the National Academy of Sciences
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biofyzika
Klíčová slova	coupled molecular motions; hairpin ribozyme; molecular dynamics; proton wire
Popis	Kombináciou explicit-solvent molekulovej dynamiky a single-molecule fluorescenčnej spektroskopie, sme našli, že ribozyme zo subvirálneho rastinného patogénu vykazuje zpriahnutú sieť vodíkových vazieb ktoré prenášajú dynamické štrukturálne zmeny naprieč katalytickým centrom ako odozva miestne-riadenej chemickej modifikácie. Zachytené molekuly vody su rozhodujúce pre túto sieť.
Související projekty:	Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím