Spectroscopic study of protonation of oligonucleotides containing adenine and cytosine

• Název česky: Spectroskopické studium protonace oligonukleotidů obsahujících adenin a cytosin
• Autoři: VOJTYLOVÁ Terézia; DOSPIVOVÁ Dana; TŘÍSKOVÁ Olga; PILAŘOVÁ Iveta; LUBAL Přemysl; FARKOVÁ Marta; TRNKOVÁ Libuše; TÁBORSKÝ Petr
• Rok publikování: 2009
• Druh: Článek v odborném periodiku
• Časopis / Zdroj: Chem. Papers
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• www: http://www.springerlink.com/content/b163418v38432172/?p=afb907946c874228a3c45a57420400e5&pi=15
• Obor: Analytická chemie, separace
• Klíčová slova: oligonucleotides; adenine; cytosine; protonation; thermodynamics; chemometrics
• Popis: Acidobazické vlastnosti purinových a pyrimidinových bazí (adenin, cytosin) a příbuzných nukleosidů (adenosin, cytidin) byly studovány potenciometricky a následující disociační konstanty byly nalezeny (I = 0.1 M (NaCl), t = (25.0 +/- 0.1) st. C): adenin (pK_HL = 9.65 +/- 0.04, pK_H2L = 4.18 +/- 0.04), adenosin (pK_H2L = 3.59 +/- 0.05), cytosin (pK_H2L = 4.56 +/- 0.01), cytidin (pK_H2L = 4.16 +/- 0.02). Navíc také termodynamické parametry pro báze byly vypočteny. Acidobazické chování oligonukleotidů ((CAC)3, A3C6, C3A3C3) bylo studováno za stejných experimentálních podmínek pomocí molekulové absorpční spektroskopie. Spektrální data jako funkce pH byly analyzovány pomocí pokročilých chemometrických technik (EFA, MCR-ALS) a přítomnost částice obsahující (C-C+) nekanonický pár (i-motiv) v uvedených oligonukleotidech byl navržen, aby bylo možné vysvětlit experimentální data ve shodě s údaji uvedenými v literatuře.

Související projekty

• Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu