Efficiency of PCR-based methods in discriminating Bifidobacterium longum ssp. longum and Bifidobacterium longum ssp. infantis strains of human origin

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Účinnost metod založených na PCR při rozlišení kmenů Bifidobacterium longum ssp. longum a Bifidobacterium longum ssp. infantis lidského původu
Autoři	ŠRŮTKOVÁ Dagmar ŠPANOVÁ Alena ŠPANO Miroslav DRÁB Vladimír SCHWARZER Martin KOZÁKOVÁ Hana RITTICH Bohuslav
Rok publikování	2011
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Journal of Microbiological Methods
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Doi	http://dx.doi.org/10.1016/j.mimet.2011.06.014
Obor	Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova	Bifidobacterium longum; PCR; ARDR; RAPD; rep-PCR
Popis	K rozlišení B. longum ssp. longum and B. longum ssp. infantis byly použity 4 molekulárně-biologické metody (polymerázová řetězová reakce (PCR), metoda náhodně amplifikované polymorfní DNA (RAPD) s 5 primery, interrepetitivní polymerázová řetězová reakce (rep-PCR) s primery pro BOXA1R elementy a (GTG)5, restrikční analýza amplifikované ribosomální DNA (ARDRA) a biochemické metody. Bylo analyzováno 28 kmenů izolovaných z 25 zdravých a plně kojených dětí a 3 dospělých jedinců a 2 sbírkové kmeny. Uvedené metody společně s fermentací arabionosy/ melezitosy rozlišily B. longum ssp. longum a B. longum ssp. infantis do podruhů pouze sbírkové kmeny. Na druhé straně ARDRA zařadila do podruhů B. longum/infantis analyzované kmeny při použití jedinné restrikční endonukleasy Sau3AI. Dále byly zařazeny do podruhů sbírkové kmeny B. longum CCM 3764 jako B. longum ssp. longum CCM 3764, B. longum ATCC 17930 jako B. longum ssp. infantis ATCC 17930.
Související projekty:	Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací Nové postupy při charakterizaci a identifikaci probiotických kmenů bakterií vhodných pro funkční potraviny