Informace o projektu
Studium lokální kontroly exprese genů pomocí spektrální mikroskopie a analýzy obrazu
- Kód projektu
- GA301/01/0186
- Období řešení
- 1/2001 - 1/2003
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Fakulta informatiky
- RNDr. Petr Mejzlík, Dr.
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Stanislav Kozubek, DrSc.
Užitím cytometrie s vysokým rozlišením jsme stanovili polohy několika genů, centromer a chromosomů v jádrech různých typů buněk a jejich změny v průběhu základních buněčných procesů jako je buněčný cyklus, diferenciace, reparace poškození apod. Také jsme zjistili, že změny v poloze genů mohou korelovat s utlumením genové exprese v průběhu diferenciace, což silně podporuje myšlenku, že struktura chromatinu představuje důležitý faktor pro regulaci exprese genů. v tomto projektu budeme studovat lokální str ukturu v těsné blízkosti genů a její vztah k expresi genů. Pro tento účel jsme vyvinuli techniku spektrální mikroskopie (SM), která nám umož·uje detekovat vzdálenosti genů pod 50 nm. Jako modelový příklad bude zkoumán globinový lokus: budou připraveny so ndy na LCR oblast a na oblast beta-globinu (značená odlišným fluorochromem), který se nachází na opačném konci celého lokusu, a jejich vzdálenosti budou změřeny ve fetální jaterní tkáni a v kostní dřeni dospělého jedince. Předpokládá se ( ale není to pro
Publikace
Počet publikací: 15
2002
-
Spatial distribution of centromeric and subtelomeric DNA sequences in interphase nuclei of human Go and stimulated lymphocytes
Biophysics of the genome and its interactions, rok: 2002
-
Structure of the human genome: Experimental results and models
Biophysics of the genome and its interactions, rok: 2002
-
The 3D structure of human chromosomes in cell nuclei
Chromosome Research, rok: 2002, ročník: 10, vydání: 7
-
Topography of genetic elements of X-chromosome relative to the cell nucleus and to the chromosome X territory determined for human lymphocytes
Gene, rok: 2002, ročník: 292, vydání: 1
2001
-
Higher-order chromatin structure of human granulocytes
Chromosoma, rok: 2001, ročník: 110, vydání: 5