Informace o projektu
Struktura lidského genomu
- Kód projektu
- IAA5004306
- Období řešení
- 1/2003 - 12/2007
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Akademie věd ČR
- Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména AV ČR
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- nuclear architecture; chromosome structure; FISH; high-resolution cytometry;
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Stanislav Kozubek, DrSc.
Po rozluštění genetického kódu je jedním z hlavních směrů výzkum lidského genomu studium jeho struktury vyššího řádu, které se stalo klíčem k pochopení nejdůležitějších buněčných procesů jako je diferenciace či transformace buňky. V tomto projektu bude systematicky zkoumána jaderná a teritoriální ropografie různých genetických elementů ve zdravých i nádorových buňkách s využitím cytometrie s vysokým rozlišením, vyvinuté v naší laboratoři. Topografie a její změny budou korelovány s lokální acetylací histonů, metylací DNA a expresí genových klastrů. Kromě toho budou studovány změny struktury chromosomových teritorií a buněčného jádra během diferenciace a kancerogeneze. Na základě získaných poznatků se budeme snažit o nalezení základních principů epigenetické regulace exprese genů. Praktickým cílem projektu bude využití získaných poznatků v diagnostice a při léčbě nádorových onemocnění.
Výsledky
Výsledkem by mělo být nalezení základních principů epigenetické regulace exprese genů. Praktickým cílem projektu bude využití získaných poznatků v diagnostice a při léčbě nádorových onemocnění.
Publikace
Počet publikací: 32
2004
-
Applications of Image Registration in Human Genome Research
Computer Vision and Mathematical Methods in Medical and Biomedical Image Analysis, rok: 2004
-
Automated acquisition and processing of multidimensional image data in confocal in vivo microscopy
Microscopy research and technique, rok: 2004, ročník: 64, vydání: 2
-
Automated confocal microscopy: The way of achieving both quality and quantity in 3D image cytometry
International Symposium on Biomedical Imaging, rok: 2004
-
Automated confocal microscopy: The way of achieving both quality and quantity in 3D image cytometry
Rok: 2004, druh: Vyžádané přednášky
-
Automated image analysis in fluorescence microscopy: From isolated cells to tissues and microarray images
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Colocalization of PML bodies and PML/RARalpha microspeckles with up- and down-regulated loci and changes of chromatin structure in APL leukemia cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Cytological study of DNA methylation and histone methylation patterns in human cell lines
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Different nuclear localization of aberrant and normal chromosome 8 homologues in intact or NaBt differentiated HT-29 cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Dynamics of HP1 transgene loci movement and silencing in living cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
From Jenalumar to Ultrafast Microscopy of Living Cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004