Informace o projektu
Struktura lidského genomu
- Kód projektu
- IAA5004306
- Období řešení
- 1/2003 - 12/2007
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Akademie věd ČR
- Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména AV ČR
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- nuclear architecture; chromosome structure; FISH; high-resolution cytometry;
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Stanislav Kozubek, DrSc.
Po rozluštění genetického kódu je jedním z hlavních směrů výzkum lidského genomu studium jeho struktury vyššího řádu, které se stalo klíčem k pochopení nejdůležitějších buněčných procesů jako je diferenciace či transformace buňky. V tomto projektu bude systematicky zkoumána jaderná a teritoriální ropografie různých genetických elementů ve zdravých i nádorových buňkách s využitím cytometrie s vysokým rozlišením, vyvinuté v naší laboratoři. Topografie a její změny budou korelovány s lokální acetylací histonů, metylací DNA a expresí genových klastrů. Kromě toho budou studovány změny struktury chromosomových teritorií a buněčného jádra během diferenciace a kancerogeneze. Na základě získaných poznatků se budeme snažit o nalezení základních principů epigenetické regulace exprese genů. Praktickým cílem projektu bude využití získaných poznatků v diagnostice a při léčbě nádorových onemocnění.
Výsledky
Výsledkem by mělo být nalezení základních principů epigenetické regulace exprese genů. Praktickým cílem projektu bude využití získaných poznatků v diagnostice a při léčbě nádorových onemocnění.
Publikace
Počet publikací: 32
2004
-
Gene expression in colorectal carcinoma determined by cDNA microarrays using a combination of several evaluation approaches.
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Image analysis of the movement of sub-cellular structures
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Rapid Image Acquisition of Living Cells and its Limits
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Relationship of HP1 proteins to centromeric heterochromatin characterized by the presence of H3(K9) and absence of H3(K4) dimethylation
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Topographic characterization of telomeres in healthy and various tumor cell lines determined in situ and in vivo
Rok: 2004, druh: Konferenční abstrakty
-
Topography of genetic loci in the nuclei of cells of colorectal carcinoma and adjacent tissue of colonic epithelium
Chromosoma, rok: 2004, ročník: 112, vydání: 5
-
Towards a Fully Automated Tissue Cell Segmentation Method
Visualization, Imaging, and Image Processing, rok: 2004
2003
-
Cytogenetics and cytology of retinoblastomas
J Cancer Res. Clin.Oncol., rok: 2003, ročník: 129, vydání: 2
-
Detailed studies of the human genome 3D structure
Biophysics of the Genome, rok: 2003
-
Chromosomal territory segmentation in apoptotic cells
Cellular and Molecular Life Sciences, rok: 2003, ročník: 60, vydání: 5