Informace o projektu
Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
- Kód projektu
- MSM0021622413
- Období řešení
- 1/2005 - 12/2011
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumné záměry
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Další fakulta/pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- Klíčová slova
- proteiny, vztah struktury a funkce proteinů, komplexy proteinů, proteom, metabolom
Návrh bezprostředně navazuje na předchozí výzkumný záměr "Strukturně funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu", řešený v letech 1998-2004, a zčásti i na projekt "Laboratoř struktury a dynamiky biomolekul" v rámci programu "250" (1996-2000). Klíčovou součástí tohoto výzkumného záměru byla identifikace a charakterizace vybraných bakteriálních proteinů a nízkomolekulárních látek účastnících se metabolismu bakterií a hub. Nově navrhovaný záměr by měl jednak zahrnout i další proteiny z jiných typů organismů, např. živočišné proteiny vážící feromony, ale hlavním přínosem bude rozšíření předmětu zájmu na interakce proteinů s okolím. Řečeno jinak, hlavní inovací bude to, že předmětem zájmu budou komplexy proteinů. Při studiu funkce a regulace enzymů se zaměříme i na rozvoj metod monitorování jejich aktivity za podmínek in vivo analýzou intracelulárních metabolitů. Zapojení odborníků z oblasti instrumentální analytické chemie a experimentální organické chemie a fotochemie umožní neomezovat se na, z pohledu řady metod, „uživatelský přístup“, ale vyvíjet vlastní aktivity k dalšímu rozvoji a implementaci těchto technik v proteomice a metabolomice. Nový záměr bude moci stavět na instrumentální základně, kterou se v minulém období podařilo výrazně posílit. Např. v letech 2001-2002 bylo sdružením prostředků z fondu SZNN MŠMT, minulého výzkumného záměru a grantu GAČR vybudováno moderní pracoviště pro analýzu proteomu, zahrnující dvoudimenzionální elektroforézu, denzitometrii s analýzou obrazu a hmotnostní spektrometrii proteinů. Vynikající je také strukturní a počítačové zázemí projektu, a to jak z hlediska instrumentálního tak z hlediska lidských zdrojů. Výrazně byla inovována molekulárně biologická infrastruktura záměru (např. zřízena nová laboratoř pro studium interakce rostlin s patogeny). Těmito změnami se otevírá pole využití moderních metod genomiky, proteomiky a metabolomiky při akcentaci biochemického a strukturního pohledu na řešenou problematiku. Celková hodnota investičních zařízení, která budou v rámci řešení výzkumného záměru používána, přesahuje částku 100 mil. Kč. Investiční úsilí podávaného výzkumného záměru bude sledovat základní myšlenku udržet alespoň rámcově krok v oblasti instrumentace používané v té části současné moderní biochemie a strukturní biologie, která se zabývá proteiny. K základním cílům výzkumného záměru v oblasti personální bude udržet na fakultě mladé kvalitní výzkumné pracovníky, kteří buď byli fakultou vychováni či na fakultu přišli v rámci vládních programů na posílení výzkumu na vysokých školách či výzkumných center.
Publikace
Počet publikací: 835
2008
-
NMR study of a single-stranded DNA binding to the C-terminal domain of the protease from murine intracisternal A-type particle
Rok: 2008, druh: Konferenční abstrakty
-
Novel radiometric enzyme assays: Extremely sensitive determination (in 10 exp-18 to 10 exp-12 katals range) of iodothyronine deiodinases activities
Proceedings, 2nd International Nuclear Chemistry Congress (M. Navarrete, ed.), Rp 23, rok: 2008, počet stran: 2 s.
-
Nový protein rhodanasového typu u Acidithiobacillus ferrooxidans - funkční studie
Chem. Listy 102, 365–404 (2008) - VIII. Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků, rok: 2008
-
On-capillary microreaction electrophoretic technique utilizing microsomes as an enzymatic system in drug metabolism studies
XII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů, rok: 2008
-
On-line preconcentration of 4-hydroxydiclofenac for MEKC separation by means of sweeping in homogenous electric field
Book of Abstracts CECE 2008, rok: 2008
-
Optimalizace exprese a purifikace rekombinantního lektinu CV-IIL z patogenního mikroorganismu Chromobacterium violaceum
Študentská vedecká konferencia 23.apríl 2008, Zborník prispevkov, 1.zväzok, biologická sekcia, rok: 2008
-
Pathways and Mechanisms for Product Exit and Water Exchange in Engineered Haloalkane Dehalogenase DhaA Exploredusing Classical and Random Acceleration Molecular Dynamics Simulations
Rok: 2008, druh: Prezentace v oblasti VaV (AV tvorba, WEB aplikace apod.)
-
Photochemical Synthesis of Substituted Indan-1-ones Related to Donepezil
Photochemical & Photobiological Sciences, rok: 2008, ročník: 7, vydání: 5
-
Photoinitiated polymerisation of monolithic stationary phases in polyimide coated capillaries using visible region LEDs
Chemical Communications, rok: 2008, ročník: 48, vydání: 28
-
Porucha barvocitu u alkoholiků a její souvislost s polymorfizmem genu pro BDNF
Česká a slovenská psychiatrie, rok: 2008, ročník: 104, vydání: 3